55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1351 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  100 
 
 		 345 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  70.55 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  49.05 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  44.06 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  37.86 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.282739 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  38.94 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  35.16 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  33.43 
 
 		 418 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  27.8 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5211  fatty acid desaturase  27.49 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  28.44 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  27.13 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  25.82 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  25.69 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  27.19 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  23.87 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46383  predicted protein  35.48 
 
 		 454 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.372126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  24.64 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  24.78 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  25.81 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  27.17 
 
 		 685 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  27.73 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  26.99 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  29.18 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  24.14 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  27.82 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  25.35 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  27.8 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  26.1 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  24.09 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  27.1 
 
 		 489 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4517  fatty acid desaturase, putative  41.67 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.61204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  26.36 
 
 		 351 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  27.67 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5424  fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0426648  normal  0.297752 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  22.77 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  25.98 
 
 		 486 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2048  Fatty acid desaturase  24.79 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  29.7 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  23.25 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  28.64 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  33.78 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  23.92 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  23.55 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  24.14 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  26.67 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  25.59 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  23.92 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  30.65 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  32.43 
 
 		 366 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  35.21 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  27.94 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  30.15 
 
 		 431 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  21.63 
 
 		 293 aa  42.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>