8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2048 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2048  Fatty acid desaturase  100 
 
 
254 aa  524  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  58.43 
 
 
258 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5230  fatty acid desaturase  50.4 
 
 
286 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0972  beta-carotene ketolase  44.1 
 
 
257 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0162897  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  51.61 
 
 
429 aa  45.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  27.92 
 
 
325 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  22.22 
 
 
321 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  27.46 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>