28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02571 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  100 
 
 
277 aa  563  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  95.47 
 
 
266 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  89.53 
 
 
299 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  98.34 
 
 
241 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  78.1 
 
 
341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  73.16 
 
 
346 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  70.76 
 
 
349 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  69.68 
 
 
370 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  74.73 
 
 
343 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  74.73 
 
 
343 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  63.37 
 
 
331 aa  345  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  63.05 
 
 
306 aa  334  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  60.25 
 
 
298 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  61.37 
 
 
291 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  61.37 
 
 
291 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  61.8 
 
 
291 aa  315  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  62.66 
 
 
293 aa  311  5.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  59.83 
 
 
325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  29.78 
 
 
371 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  31.98 
 
 
685 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  31.91 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.45 
 
 
342 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  35.44 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  37.68 
 
 
469 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.71 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  23.31 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  22.03 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  21.62 
 
 
368 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>