10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4517 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4517  fatty acid desaturase, putative  100 
 
 		 316 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.61204  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  28.52 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2059  hypothetical protein  24.24 
 
 		 347 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.383328  normal  0.370855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6631  fatty acid desaturase  24.89 
 
 		 361 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.1294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  41.67 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0156  fatty acid desaturase  39.13 
 
 		 358 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  33.33 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.282739 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00963  ORF Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79037]  31.96 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  42.55 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  38.89 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>