10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0156 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0156  fatty acid desaturase  100 
 
 
358 aa  748    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6631  fatty acid desaturase  56.39 
 
 
361 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.1294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2059  hypothetical protein  58.77 
 
 
347 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.383328  normal  0.370855 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00963  ORF Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79037]  34.14 
 
 
436 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10629  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 
435 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.734227 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26849  predicted protein  28.4 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0175357  normal  0.455832 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  22.13 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4517  fatty acid desaturase, putative  39.13 
 
 
316 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.61204  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  22.22 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  22.51 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>