18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5527 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4517  fatty acid desaturase, putative  28.52 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.61204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6631  fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.1294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  24.79 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.58 
 
 		 765 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.89 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  25.23 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  22.97 
 
 		 362 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0156  fatty acid desaturase  25.88 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  25.22 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  23.93 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  22.54 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  23.25 
 
 		 349 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>