30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_02681 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  89.53 
 
 
277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  75.68 
 
 
341 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  87.22 
 
 
266 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  70.31 
 
 
370 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  74.66 
 
 
343 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  74.66 
 
 
343 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  69.59 
 
 
346 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  70.65 
 
 
349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  87.97 
 
 
241 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  61.45 
 
 
331 aa  361  9e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  58.61 
 
 
306 aa  328  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  58.27 
 
 
291 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  56.67 
 
 
298 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  58.27 
 
 
291 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  64.1 
 
 
291 aa  317  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  60.66 
 
 
293 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  54.07 
 
 
325 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  29.29 
 
 
371 aa  93.2  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  31.62 
 
 
685 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  35.15 
 
 
309 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.27 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  24.9 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  35.16 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  34.57 
 
 
311 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  20.65 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  30.04 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  22.54 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>