42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1693 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  87.03 
 
 
293 aa  528  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  68.28 
 
 
291 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  68.77 
 
 
298 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  68.28 
 
 
291 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  69.75 
 
 
291 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  64.33 
 
 
331 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  62.37 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  59.23 
 
 
349 aa  362  6e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  57.84 
 
 
370 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  57.34 
 
 
341 aa  352  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  55.25 
 
 
346 aa  344  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  63.05 
 
 
277 aa  334  9e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  57.69 
 
 
343 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  57.34 
 
 
343 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  64.17 
 
 
266 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  58.61 
 
 
299 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  63.72 
 
 
241 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  30.65 
 
 
371 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  29.54 
 
 
685 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  32.11 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  27.11 
 
 
353 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  23.89 
 
 
330 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  25.9 
 
 
360 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  25.93 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  25.93 
 
 
343 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  25.93 
 
 
333 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  25.93 
 
 
333 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  25.93 
 
 
333 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  25.93 
 
 
333 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  25.46 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  22.52 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  25.53 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  23.17 
 
 
367 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  24.77 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  24.7 
 
 
368 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  22.83 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  23.26 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  32.56 
 
 
320 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.61 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  32.94 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>