69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5215 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  54.98 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  52.87 
 
 		 321 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  52.4 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  44.94 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  43.89 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  40 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  40 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  40 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  40 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  40 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  39.45 
 
 		 540 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  39.26 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  38.34 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  33.88 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  31.66 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  31.3 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  31.79 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  35.71 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  35.71 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  35.71 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  31.07 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  31.07 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  31.07 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  31.07 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  29.25 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  26.91 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  24.66 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  26.49 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  26.67 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  28.75 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  26.83 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  27.05 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  28.03 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  29.11 
 
 		 463 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  25.38 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.33 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  29.68 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  24.57 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  22.97 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.95 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  28.91 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  27.15 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.33 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  22.68 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.33 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  25.31 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  24.01 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  22.92 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  22.11 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  25.41 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  23.55 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  21.5 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.85 
 
 		 765 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 362 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  21.9 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  29.26 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  29.26 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  24.04 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  29.13 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  28.43 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  24.16 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  22.11 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  26.12 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  23.46 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  32.94 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>