58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6729 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  100 
 
 		 333 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.27 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  27.24 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  26.48 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  23.02 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  32.65 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  32.65 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  22.66 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  27.94 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.66 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.5 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.1 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  24.33 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.77 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  25 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  26.05 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  26.05 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  26.05 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  26.05 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  26.05 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  27.68 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.77 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  26.05 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3079  fatty acid desaturase  23.98 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  27.94 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.35 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  27.94 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  29.22 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  30.3 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  25.63 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  28.63 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  24.2 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  29.1 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  28.4 
 
 		 431 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  21.77 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  28.21 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  25.11 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  26.11 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5106  fatty acid desaturase  26.62 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  22.19 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  24.39 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  23.68 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  24.08 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  24.35 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5211  fatty acid desaturase  25.65 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  23.11 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  26.34 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  25.43 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  26.94 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  20.69 
 
 		 359 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  33.8 
 
 		 277 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  28.3 
 
 		 370 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  24.54 
 
 		 363 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>