47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5096 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  100 
 
 		 341 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  95.31 
 
 		 341 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  87.98 
 
 		 341 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  87.1 
 
 		 341 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  87.1 
 
 		 341 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  86.22 
 
 		 341 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  81.52 
 
 		 431 aa  564  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 346 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 346 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  73.91 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  75.59 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  50.48 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  46.33 
 
 		 368 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  48.05 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  47.45 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  45.83 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  47.48 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  50 
 
 		 312 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  43.49 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  35.78 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  37.16 
 
 		 290 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  39.48 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  36.78 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  26.03 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  27.6 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  27.15 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  27.15 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  27.15 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  27.15 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  27.15 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  27.15 
 
 		 540 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  27.06 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.85 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  28.63 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.09 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  27.76 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  22.57 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  27.57 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  28.82 
 
 		 486 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  29.82 
 
 		 489 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>