49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3247 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  95.31 
 
 		 341 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  100 
 
 		 341 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  87.98 
 
 		 341 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  86.8 
 
 		 341 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  86.8 
 
 		 341 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  85.92 
 
 		 341 aa  584  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  80.94 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.33 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.04 
 
 		 346 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  73.04 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.91 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.04 
 
 		 359 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.04 
 
 		 359 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  73.04 
 
 		 346 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  75.15 
 
 		 390 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  51.75 
 
 		 313 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  45.75 
 
 		 368 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  47.45 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  47.08 
 
 		 355 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  44.55 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  46.96 
 
 		 367 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  48.41 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  43.73 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  36.82 
 
 		 290 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  35.87 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  38.52 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  35.63 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  26.02 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.16 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.69 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  25.9 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  25.9 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  25.9 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 540 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  21.68 
 
 		 293 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  25 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  28.63 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  27.78 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  28.1 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  28.38 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25.49 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  25 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  27.52 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  21.08 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>