44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5711 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  100 
 
 
330 aa  670    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  78.66 
 
 
367 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  67.27 
 
 
368 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  50.65 
 
 
355 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  48.08 
 
 
431 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  47.76 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  47.45 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  47.76 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  48.39 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  47.44 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  46.82 
 
 
341 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  46.39 
 
 
424 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  46.39 
 
 
359 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  46.39 
 
 
359 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  46.39 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  46.39 
 
 
359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  46.39 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  46.39 
 
 
359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  47 
 
 
390 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  47.45 
 
 
341 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  44.07 
 
 
313 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  45.63 
 
 
312 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  39.3 
 
 
296 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  35.93 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  34.14 
 
 
290 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  33.78 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  27.55 
 
 
343 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  25.57 
 
 
329 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  28.19 
 
 
363 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
328 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
328 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  24.67 
 
 
328 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  24.67 
 
 
328 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  24.67 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5835  fatty acid desaturase domain-containing protein  55 
 
 
60 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.805516  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  24.58 
 
 
540 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  27.48 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  22.03 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  21.61 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  31.88 
 
 
685 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  25.11 
 
 
315 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  27.39 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  23.26 
 
 
306 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  23.32 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>