76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2767 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  100 
 
 
363 aa  751    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  61.9 
 
 
362 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  61.9 
 
 
362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  61.9 
 
 
363 aa  434  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  58.7 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  60.12 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  59.59 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  58.93 
 
 
340 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  58.28 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  57.99 
 
 
360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  58.28 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  54.76 
 
 
362 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.61 
 
 
765 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  48.91 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  40.68 
 
 
475 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  35.64 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  29.45 
 
 
336 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  30.69 
 
 
311 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.26 
 
 
300 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.75 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  25.14 
 
 
427 aa  86.3  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  29.32 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  29.32 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  29.32 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  29.32 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  29.32 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  29.32 
 
 
540 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  28.97 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25.58 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  26.15 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  29.3 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.85 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.95 
 
 
339 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.9 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  27.15 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  25 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  24.39 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
361 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
361 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  25 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  27.53 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  23.76 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  25.21 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.46 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  24.11 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  27.66 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.46 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  24.36 
 
 
372 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
318 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  28.19 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  40 
 
 
495 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  29.25 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  25.19 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  23.38 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  26.79 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  32.26 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  22.07 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  23.6 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  21.76 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  29.57 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.03 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  25.47 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  28.33 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  22.35 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  24.31 
 
 
370 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  23.39 
 
 
356 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  25.79 
 
 
429 aa  43.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>