43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1666 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.42 
 
 
346 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.42 
 
 
346 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  98.89 
 
 
359 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  98.61 
 
 
359 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.16 
 
 
359 aa  718    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  99.16 
 
 
359 aa  718    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  100 
 
 
424 aa  854    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  85.32 
 
 
390 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  73.91 
 
 
341 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  73.62 
 
 
341 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  74.2 
 
 
341 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  74.2 
 
 
341 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  73.33 
 
 
431 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  75.3 
 
 
341 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  73.33 
 
 
341 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  45.48 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4347  Fatty acid desaturase  49.84 
 
 
313 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  46.39 
 
 
330 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  47.52 
 
 
355 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  47.95 
 
 
367 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  44.72 
 
 
328 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67380  putative fatty acid desaturase  50.47 
 
 
312 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  43.69 
 
 
296 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  36.86 
 
 
290 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  36.49 
 
 
318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  38.83 
 
 
304 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4336  fatty acid desaturase  37.35 
 
 
343 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  28.57 
 
 
328 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
328 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  28.57 
 
 
328 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  28.27 
 
 
540 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
328 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  28.27 
 
 
328 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.21 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  28.96 
 
 
311 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.59 
 
 
339 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  22.57 
 
 
325 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.75 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  24.48 
 
 
429 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  25.91 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  29.26 
 
 
489 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  23.99 
 
 
324 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>