83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0282 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  99.39 
 
 
328 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  100 
 
 
328 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  95.73 
 
 
329 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  100 
 
 
328 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  100 
 
 
328 aa  663    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  100 
 
 
540 aa  1043    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  100 
 
 
328 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  62.85 
 
 
339 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  41.42 
 
 
343 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  39.94 
 
 
321 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  39.45 
 
 
307 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  40 
 
 
330 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  38.58 
 
 
320 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  37.89 
 
 
339 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  36.84 
 
 
311 aa  173  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  34.49 
 
 
333 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  34.49 
 
 
333 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  34.49 
 
 
333 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  34.49 
 
 
333 aa  120  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  34.18 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  34.18 
 
 
333 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  33.45 
 
 
315 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  33.09 
 
 
315 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  34.55 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  31.25 
 
 
338 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  29.05 
 
 
336 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  28.04 
 
 
330 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  31.37 
 
 
314 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  30.74 
 
 
313 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  28.25 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  26.77 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  29.92 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  29.32 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  26.49 
 
 
324 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  26.27 
 
 
362 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  28.4 
 
 
378 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  29.27 
 
 
360 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  30.36 
 
 
360 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  27.34 
 
 
315 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  25.39 
 
 
353 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  25.84 
 
 
350 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  28.86 
 
 
360 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  26.36 
 
 
340 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  28.86 
 
 
360 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  27.39 
 
 
358 aa  60.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  26.15 
 
 
314 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  26.14 
 
 
344 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
489 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.33 
 
 
330 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0220  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.42 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  24.59 
 
 
363 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.61 
 
 
765 aa  58.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  26.61 
 
 
362 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  26.37 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  28.4 
 
 
315 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
336 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  27.62 
 
 
300 aa  53.9  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  24.63 
 
 
427 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  23.99 
 
 
362 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.85 
 
 
424 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  23.38 
 
 
378 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  39.71 
 
 
463 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  26.4 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  25.27 
 
 
317 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  43.55 
 
 
342 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
431 aa  48.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  43.55 
 
 
315 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  43.55 
 
 
315 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  26.1 
 
 
328 aa  47.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.75 
 
 
346 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.75 
 
 
346 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  28.07 
 
 
341 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.39 
 
 
359 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.39 
 
 
359 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  27.1 
 
 
341 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  26.89 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  27.1 
 
 
341 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  25 
 
 
341 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  25.52 
 
 
372 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.82 
 
 
359 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  23.21 
 
 
475 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  25.82 
 
 
359 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  21.93 
 
 
313 aa  43.9  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>