84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5636 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  100 
 
 
315 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  100 
 
 
315 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  100 
 
 
342 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  93.65 
 
 
315 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  89.52 
 
 
315 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  30.63 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.52 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  28.4 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  28.93 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  27.57 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  31.33 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  31.33 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  31.33 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  31.33 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.39 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  30.9 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  26.91 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.62 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  25.42 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  25.2 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  27.13 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  25.27 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  27.69 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24.58 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  26.36 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  21.99 
 
 
344 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  21.84 
 
 
343 aa  53.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  27.69 
 
 
311 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  28.95 
 
 
431 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  28.78 
 
 
304 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.66 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  23.57 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  24.44 
 
 
340 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  23.91 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  23.62 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  25.84 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  27.67 
 
 
486 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.28 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  26.05 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  22.41 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  24.05 
 
 
336 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  24.51 
 
 
313 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  26.59 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  25.99 
 
 
489 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  23.74 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  23.74 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  23.74 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  21.85 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  23.74 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  22.07 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  23.74 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  23.74 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  23.74 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  22.07 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  22.73 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  25.61 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  32.88 
 
 
427 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  37.1 
 
 
517 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  26.96 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  25 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  22.9 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.48 
 
 
475 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  22.11 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  21.12 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1666  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.04 
 
 
424 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2216  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.94 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1937  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.94 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  25.32 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1241  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.94 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0954  fatty acid desaturase domain-containing protein  26.94 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  30.16 
 
 
362 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  22.09 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  25.95 
 
 
314 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  22.09 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
343 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0299  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.31 
 
 
359 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  26.39 
 
 
341 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  26.39 
 
 
341 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0209  fatty acid desaturase family protein  27.31 
 
 
359 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  32.5 
 
 
362 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  28.33 
 
 
341 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>