57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5042 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  100 
 
 		 309 aa  633    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  27.17 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  28.94 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  29.67 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  29.41 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  29.67 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  29.67 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  27.09 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  26.67 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  28.04 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.47 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  26.84 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  22.86 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  25.95 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  29.3 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  27.59 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  26.75 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  24.23 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  28.03 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  25.81 
 
 		 363 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  23.18 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  26.8 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  30.45 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  24.2 
 
 		 358 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  25.38 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  24.14 
 
 		 357 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  28.95 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.79 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.79 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  29.26 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  27.56 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.38 
 
 		 765 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  28.03 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  29.59 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  29.59 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  29.59 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_003296  RS02366  putative transmembrane acyl-COA desaturase (fatty acid desaturase) oxidoreductase protein  36.84 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0749638 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  23.05 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  29.03 
 
 		 374 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  28.68 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  23.79 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  24.24 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  24.24 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  24.24 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  26.35 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  24.24 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  24.24 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  25.56 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  24.52 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  24.52 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  24.52 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  37.74 
 
 		 436 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  24.24 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.99 
 
 		 391 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>