56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6514 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  100 
 
 		 314 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  50.32 
 
 		 313 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  49.08 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  43.46 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  26.84 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  30.3 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  27.65 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  29.24 
 
 		 350 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  29.37 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  25.54 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  26 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  26 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  26 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  26 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  27.76 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  26 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  26 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  30.8 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  26 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.77 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  26.34 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.15 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.15 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.15 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.15 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  27.07 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.15 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  28.45 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.15 
 
 		 540 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  28.69 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.86 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.41 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  39 
 
 		 119 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  26.03 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  21.81 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  26.15 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  22.99 
 
 		 489 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  31 
 
 		 463 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  24.01 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  27.53 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  24.08 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  35.06 
 
 		 113 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.19 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  25.35 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  24.04 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  26.22 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  23.42 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  23.42 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  25.56 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  23.42 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  22.55 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  24.11 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  23.64 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  23.9 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>