65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1703 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  100 
 
 		 350 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  48.62 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  36.79 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  33.83 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  29.56 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  28.03 
 
 		 313 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  29.6 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  27.24 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  29.18 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  32.65 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  27.8 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  28.22 
 
 		 333 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  28.68 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  27.8 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  27.13 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  27.05 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  27.31 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  26.2 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  25.55 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  25.7 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  27.04 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  27.94 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  30.51 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  25.08 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  24.75 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  24.75 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  24.75 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  24.75 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  24.75 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  28.63 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  27.62 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.96 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3477  fatty acid desaturase  24.56 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.39 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4357  fatty acid desaturase  27.08 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.1 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  25.81 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  22.77 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  28.08 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  27.69 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  27.41 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  23.3 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  23.22 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  33.77 
 
 		 113 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  27.44 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  25.39 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.29 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  25.18 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  21.72 
 
 		 349 aa  46.2  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6169  fatty acid desaturase  25.62 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88883  decreased coverage  0.00544471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  35.71 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  22.11 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  37.74 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  21.66 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  23.75 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  20.71 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  23.98 
 
 		 427 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  24.78 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>