38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3890 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  35.27 
 
 		 685 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  29.56 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  31.23 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  32.11 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  31.23 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  31 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  32.71 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  34 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  34.39 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  35.15 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  32.27 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  30.14 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  29.77 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  31.91 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  30.04 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  31.17 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  31.46 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  31.46 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  29.07 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  24.83 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  28.91 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.39 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  25.89 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  23.44 
 
 		 353 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.89 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.33 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  27.67 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.57 
 
 		 352 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  24.26 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  24.43 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  45.28 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  35.05 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  23.93 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  24.46 
 
 		 380 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  30.21 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  22.64 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>