83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2878 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  100 
 
 
286 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  51.67 
 
 
376 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  38.55 
 
 
352 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  38.55 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  36.16 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  40 
 
 
351 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  39.46 
 
 
352 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  35.75 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.14 
 
 
359 aa  96.3  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  32.89 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  32.21 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  29.07 
 
 
359 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  45.31 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  31.45 
 
 
418 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  26.5 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  27.52 
 
 
405 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.75 
 
 
405 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  32.46 
 
 
495 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  28.7 
 
 
387 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  26.52 
 
 
448 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  40.24 
 
 
393 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  28.87 
 
 
436 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  27.04 
 
 
435 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  29.46 
 
 
344 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  28.35 
 
 
471 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.37 
 
 
391 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  28.37 
 
 
388 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  34.15 
 
 
180 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  27.67 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  28.05 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  28.05 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  34.62 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  34.43 
 
 
394 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  30.6 
 
 
381 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  30.36 
 
 
375 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  27.97 
 
 
357 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  27.14 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  32.95 
 
 
380 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  24.02 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  29.2 
 
 
356 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  24.02 
 
 
358 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
374 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
374 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  35.38 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  27.97 
 
 
362 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  29.41 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  29.41 
 
 
343 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  33.77 
 
 
330 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  29.41 
 
 
343 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  29.41 
 
 
343 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  31.18 
 
 
346 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  33.1 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  24.36 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  29.66 
 
 
319 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  29.66 
 
 
319 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  29.66 
 
 
319 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  21.76 
 
 
348 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  30.11 
 
 
344 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  38.57 
 
 
364 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  35.29 
 
 
349 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  27.41 
 
 
353 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  33.7 
 
 
328 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.72 
 
 
376 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  27.41 
 
 
352 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  35.82 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  31 
 
 
486 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  30.85 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  33.05 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  29.25 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  29.57 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  45.28 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 
424 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 
424 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  40.74 
 
 
454 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 
424 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 
426 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  40.74 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  40.74 
 
 
424 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  40.74 
 
 
410 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  27.84 
 
 
351 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  31.4 
 
 
349 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  22.12 
 
 
335 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  34.48 
 
 
353 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>