151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4655 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  100 
 
 
381 aa  790    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  56.7 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  54.99 
 
 
363 aa  415  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  41.81 
 
 
365 aa  311  9e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  45.22 
 
 
360 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  43.42 
 
 
366 aa  302  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  39.78 
 
 
366 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  37.18 
 
 
356 aa  252  8.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  38.11 
 
 
362 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  37.96 
 
 
364 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  37.54 
 
 
364 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  37.68 
 
 
364 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  36.59 
 
 
426 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  35.54 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  30.96 
 
 
365 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  33.14 
 
 
386 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  31.94 
 
 
491 aa  175  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  27.81 
 
 
466 aa  150  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  27.46 
 
 
465 aa  150  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  31.12 
 
 
354 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  25.82 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  26.85 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  25 
 
 
453 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  29.21 
 
 
469 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  27.19 
 
 
459 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  28 
 
 
361 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  26.23 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  26.82 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  28.18 
 
 
370 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  27.1 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.2 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  25.66 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  27.01 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  25.68 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  26.13 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  26.17 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  26.97 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  25.34 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  25.34 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  27.87 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  25.77 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  24.23 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  28.08 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  24.23 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  25.8 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  26.05 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  24.36 
 
 
452 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  25 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  24.06 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  24.04 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  26.22 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  24.83 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  25.4 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  26.59 
 
 
401 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  28.38 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  24.93 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  25.4 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  24.18 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  27.01 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  25.33 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  24.6 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  24.6 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  24.87 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  24.87 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  23.68 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  24.87 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  24.04 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  25.57 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  25.22 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  25.7 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  23.91 
 
 
535 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  31.09 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  26.85 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  25.78 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  23.72 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  23.17 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  27.13 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  26.25 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  26.75 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  31.09 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  26.42 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  25.23 
 
 
517 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  25.5 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  28 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  25 
 
 
448 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  28.26 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  23.47 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  24.65 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  24.71 
 
 
364 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25.56 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  24.23 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>