90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0028 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  96.22 
 
 		 346 aa  693    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  100 
 
 		 344 aa  708    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  62.35 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  62.35 
 
 		 410 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  57.94 
 
 		 380 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  62.35 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  62.35 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  62.35 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  62.35 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  64.21 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  65.17 
 
 		 313 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  63.12 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  57.19 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  56.4 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  34.25 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  34.25 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  27.85 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.39 
 
 		 359 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  28.76 
 
 		 352 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  27.17 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  28.03 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.34 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  22.95 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.2 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  27.24 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  29.08 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  27.03 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  27.03 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  27.03 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  27.03 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  27.03 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  27.82 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.4 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  27.03 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  27.82 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  27.03 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  27.8 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  24.75 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  21.01 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.7 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  27.13 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  23.81 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.6 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  26.21 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  27.66 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  23.51 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  25.34 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  26.24 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  24.37 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  22.74 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  27.07 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  27.2 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  25.9 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  22.49 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  25.5 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  41.89 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  22.82 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  26.02 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.8 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  20.76 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  22.16 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  36.62 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  21.21 
 
 		 495 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  26.09 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.94 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  30.11 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  24.16 
 
 		 435 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  22.5 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  23.02 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  21.65 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  38.18 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  23.93 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  21.2 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  30.67 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  36.36 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  37.93 
 
 		 362 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>