65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1778 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  100 
 
 
336 aa  701    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  31.53 
 
 
330 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  31.68 
 
 
378 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  28.71 
 
 
350 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  32.52 
 
 
353 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  28.34 
 
 
330 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  26.74 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  27.86 
 
 
320 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  28.96 
 
 
339 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  29.05 
 
 
540 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  29.05 
 
 
328 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  29.05 
 
 
329 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  29.05 
 
 
328 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  29.05 
 
 
328 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  29.05 
 
 
328 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  29.05 
 
 
328 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  26.84 
 
 
314 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  21.53 
 
 
338 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  27.85 
 
 
313 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  26.41 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  25.11 
 
 
333 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  25.11 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  25.11 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  25.11 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  25.11 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  25.11 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  23.43 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  25.11 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
307 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  20.96 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  24.18 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  24.33 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  41.98 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  24.11 
 
 
486 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  21.75 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  23.18 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  22.89 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  21.48 
 
 
489 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  22.48 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3477  fatty acid desaturase  18.45 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3059  fatty acid desaturase  22.9 
 
 
371 aa  52.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.94 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  23.18 
 
 
309 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  20.41 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  19.27 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  32.99 
 
 
685 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  21.83 
 
 
291 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  19.88 
 
 
346 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40020  hypothetical protein  22.54 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  22.98 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  24.33 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  20.99 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  21.43 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  19.92 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  20.65 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  21.24 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5230  fatty acid desaturase  32.52 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  20.52 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2950  hypothetical protein  24.75 
 
 
406 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  20.45 
 
 
359 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  21.74 
 
 
298 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  19.53 
 
 
477 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  30.21 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>