110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29488 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  100 
 
 		 477 aa  992    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  31.91 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  29.32 
 
 		 341 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  29.28 
 
 		 346 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  31.84 
 
 		 347 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  27.37 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  28.89 
 
 		 362 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  32.12 
 
 		 347 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  28.49 
 
 		 366 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  30.26 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  27.32 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  30.22 
 
 		 357 aa  136  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  27.39 
 
 		 545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  28 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  29.23 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  29.54 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  29.26 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  27.45 
 
 		 357 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  26.29 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  28.18 
 
 		 321 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  26.95 
 
 		 573 aa  113  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  27.11 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  28.61 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  24.14 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25.58 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  27.76 
 
 		 375 aa  97.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  26.59 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  28.73 
 
 		 366 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  23.24 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  25.95 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  24 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  23.88 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  40.26 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  31.58 
 
 		 891 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04424  mitochondrial cytochrome b2-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07020)  29.8 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00446587  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487731 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  39.51 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  22.72 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  42.42 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  25.79 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  39.47 
 
 		 866 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  33.33 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  23.31 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9095  predicted protein  43.06 
 
 		 72 aa  57  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  28.7 
 
 		 366 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  28.85 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31632  outer mitochondrial membrane isoform  40.28 
 
 		 164 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0689191 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02590  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000954672  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  24.18 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  25.08 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15510  predicted protein  45.07 
 
 		 141 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  25.84 
 
 		 362 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  34.88 
 
 		 510 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  33.71 
 
 		 158 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  26.19 
 
 		 364 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53263  cytochrome b2, mitochondrial precursor  40 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.792612 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16195  predicted protein  37.08 
 
 		 111 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_6435  predicted protein  37.08 
 
 		 111 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000000495197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  30.19 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  28.93 
 
 		 1016 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11198  conserved hypothetical protein  37.78 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.788645 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 		 364 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  29.35 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  29.35 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04570  conserved hypothetical protein  35.8 
 
 		 514 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 369 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  29.17 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  34.43 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  30.26 
 
 		 760 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07984  conserved hypothetical protein  36.25 
 
 		 503 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.11632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  30 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  28.95 
 
 		 394 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  28.17 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  33.75 
 
 		 873 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  29.87 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  29.47 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  31.96 
 
 		 500 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  30.67 
 
 		 378 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  36.84 
 
 		 440 aa  47.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18771  predicted protein  32.94 
 
 		 345 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71538  cytochrome b5  29.33 
 
 		 124 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  27.55 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  27.17 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  31.17 
 
 		 382 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  37.14 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  37.14 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  26.47 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  27.36 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  41.82 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  26 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  26 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  26 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  36.23 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  28.05 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  37.29 
 
 		 635 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  29.87 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  25 
 
 		 376 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  36.21 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>