71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42944 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  100 
 
 
376 aa  775    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  55.53 
 
 
369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  44.39 
 
 
490 aa  300  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  39.49 
 
 
204 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  44.51 
 
 
206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  35.64 
 
 
210 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  34.45 
 
 
225 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  36.36 
 
 
215 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  34.69 
 
 
235 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  34.78 
 
 
222 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  31.75 
 
 
209 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  36.18 
 
 
220 aa  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  46.75 
 
 
552 aa  70.5  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  33.85 
 
 
555 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53263  cytochrome b2, mitochondrial precursor  51.92 
 
 
490 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.792612 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  54.72 
 
 
561 aa  63.2  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  30.46 
 
 
186 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  56.86 
 
 
500 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  33.11 
 
 
209 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  40.23 
 
 
510 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04424  mitochondrial cytochrome b2-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07020)  51.92 
 
 
494 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00446587  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  32.41 
 
 
209 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04570  conserved hypothetical protein  51.92 
 
 
514 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02069  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04710)  42.67 
 
 
136 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  32.87 
 
 
209 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  45.16 
 
 
158 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  32.45 
 
 
209 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02590  conserved hypothetical protein  47.17 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000954672  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  32.45 
 
 
209 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  31.79 
 
 
209 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  32.05 
 
 
209 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  34.32 
 
 
182 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  33.11 
 
 
209 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  32.45 
 
 
209 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07984  conserved hypothetical protein  50.98 
 
 
503 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11632 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  33.11 
 
 
209 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71538  cytochrome b5  33 
 
 
124 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05146  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07200)  51.02 
 
 
475 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97854  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  52.08 
 
 
635 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9095  predicted protein  44.93 
 
 
72 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143106  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 
210 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  34.92 
 
 
891 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  47.17 
 
 
593 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  46.43 
 
 
668 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_9043  predicted protein  36.36 
 
 
74 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  28.38 
 
 
276 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30770  predicted protein  33.33 
 
 
133 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11198  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.788645 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06394  acyl-CoA dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10880)  47.83 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.263695  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  43.14 
 
 
587 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05828  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07720)  46.81 
 
 
84 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  43.14 
 
 
587 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  43.75 
 
 
659 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  37.5 
 
 
866 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  26.43 
 
 
252 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31632  outer mitochondrial membrane isoform  34.15 
 
 
164 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0689191 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01620  L-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  46 
 
 
592 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1930  cytochrome b5  34.85 
 
 
122 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44466  NADPH cytochrome B5 oxidoreductase-like protein  27.16 
 
 
139 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.533393  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 
458 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487731 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  32 
 
 
498 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  25 
 
 
477 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  40 
 
 
627 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80729  cytochrome b2, mitochondrial precursor  27.1 
 
 
581 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4296  cytochrome b5  31.43 
 
 
122 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506195  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  25.67 
 
 
183 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1217  cytochrome b5  30 
 
 
121 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.832153  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01699  acyl-CoA dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08490)  45.16 
 
 
564 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0281763 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12783  predicted protein  40.43 
 
 
517 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00554714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  29.08 
 
 
287 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  35.62 
 
 
491 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>