68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71538 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_71538  cytochrome b5  100 
 
 
124 aa  251  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  48.78 
 
 
510 aa  100  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02069  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04710)  56.41 
 
 
136 aa  98.2  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  45.95 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  44.74 
 
 
458 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487731 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11198  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
452 aa  83.6  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.788645 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31632  outer mitochondrial membrane isoform  42.86 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0689191 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30770  predicted protein  38.71 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9095  predicted protein  47.06 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143106  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_9043  predicted protein  41.89 
 
 
74 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  46.88 
 
 
555 aa  70.5  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53263  cytochrome b2, mitochondrial precursor  44.44 
 
 
490 aa  67.8  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.792612 
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  38.81 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  36.36 
 
 
659 aa  65.5  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  42.86 
 
 
369 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44466  NADPH cytochrome B5 oxidoreductase-like protein  36 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.533393  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  36.71 
 
 
490 aa  64.3  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06394  acyl-CoA dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10880)  33.33 
 
 
512 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.263695  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01090  cytoplasm protein, putative  46.43 
 
 
305 aa  63.9  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  43.1 
 
 
500 aa  63.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  43.64 
 
 
587 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  43.64 
 
 
587 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  34.48 
 
 
891 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  38.16 
 
 
627 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80729  cytochrome b2, mitochondrial precursor  42.86 
 
 
581 aa  62  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  47.27 
 
 
635 aa  61.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04570  conserved hypothetical protein  44.07 
 
 
514 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_6435  predicted protein  32.91 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000000495197  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  37.5 
 
 
866 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16195  predicted protein  32.91 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  36.62 
 
 
873 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  36.56 
 
 
1016 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  45.28 
 
 
593 aa  58.9  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01650  acyl-CoA dehydrogenase, long-chain specific precursor, putative  41.18 
 
 
522 aa  57.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02590  conserved hypothetical protein  43.14 
 
 
488 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000954672  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1930  cytochrome b5  31.51 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  40.74 
 
 
561 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04424  mitochondrial cytochrome b2-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07020)  35.09 
 
 
494 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00446587  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  33 
 
 
376 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70693  stearoyl-CoA desaturase  33.72 
 
 
484 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441188  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  35.59 
 
 
668 aa  54.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12783  predicted protein  31.65 
 
 
517 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00554714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1217  cytochrome b5  30.68 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.832153  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08420  conserved hypothetical protein  38.6 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01620  L-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  36.07 
 
 
592 aa  53.9  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1363  cytochrome b5  34.62 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386102  normal  0.151412 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05146  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07200)  38.6 
 
 
475 aa  53.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97854  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05828  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07720)  41.82 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01699  acyl-CoA dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08490)  37.93 
 
 
564 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0281763 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07984  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 
503 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11632 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01180  stearoyl-CoA 9-desaturase, putative  37.88 
 
 
594 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443597  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48736  stearoyl-CoA desaturase  32.05 
 
 
508 aa  50.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15510  predicted protein  31.17 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4296  cytochrome b5  27.85 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506195  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50347  predicted protein  31.94 
 
 
430 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0373397  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03798  heme/steroid binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03880)  44.83 
 
 
372 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00146693  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49358  predicted protein  31.94 
 
 
430 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000328404  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  37.74 
 
 
498 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  35.14 
 
 
491 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06731  Stearic acid desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJU5]  37.31 
 
 
455 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4191  cytochrome b5  27.5 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  29.33 
 
 
477 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04135  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
449 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513143  normal  0.101908 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  34.48 
 
 
600 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  38.1 
 
 
535 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  37.93 
 
 
573 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  28.81 
 
 
545 aa  41.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18771  predicted protein  25.56 
 
 
345 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>