50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4191 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4191  cytochrome b5  100 
 
 		 115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4296  cytochrome b5  80.7 
 
 		 122 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1217  cytochrome b5  70.54 
 
 		 121 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.832153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1930  cytochrome b5  66.67 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1363  cytochrome b5  45.95 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386102  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  43.75 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04424  mitochondrial cytochrome b2-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07020)  40.68 
 
 		 494 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00446587  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02590  conserved hypothetical protein  42.31 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000954672  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  40.26 
 
 		 498 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  43.64 
 
 		 587 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  43.64 
 
 		 587 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  40.74 
 
 		 668 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  35.53 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15510  predicted protein  40 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  40.85 
 
 		 561 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31632  outer mitochondrial membrane isoform  34.38 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0689191 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  35.19 
 
 		 500 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30770  predicted protein  32.58 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11198  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 452 aa  53.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.788645 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9095  predicted protein  32.89 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143106  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  31.94 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12783  predicted protein  38.89 
 
 		 517 aa  50.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00554714 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487731 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  41.51 
 
 		 593 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 		 552 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  35.19 
 
 		 659 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  33.33 
 
 		 635 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02069  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04710)  29.76 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71538  cytochrome b5  27.5 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01090  cytoplasm protein, putative  48.78 
 
 		 305 aa  47  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  37.74 
 
 		 555 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80729  cytochrome b2, mitochondrial precursor  33.72 
 
 		 581 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  34.92 
 
 		 1016 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  29.33 
 
 		 627 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53263  cytochrome b2, mitochondrial precursor  32.65 
 
 		 490 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.792612 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04570  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  31.17 
 
 		 891 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_9043  predicted protein  35.21 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  30.43 
 
 		 866 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05828  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07720)  30.95 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_6435  predicted protein  31.75 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000000495197  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08420  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16195  predicted protein  31.75 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44466  NADPH cytochrome B5 oxidoreductase-like protein  31.17 
 
 		 139 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.533393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  31.11 
 
 		 490 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26067  predicted protein  30.59 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.214309 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01620  L-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  34 
 
 		 592 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05146  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07200)  37.25 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97854  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  32.65 
 
 		 369 aa  40  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  28.42 
 
 		 873 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>