51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01090 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN01090  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
305 aa  628  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44466  NADPH cytochrome B5 oxidoreductase-like protein  51.72 
 
 
139 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.533393  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03798  heme/steroid binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03880)  50.86 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00146693  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16195  predicted protein  37.04 
 
 
111 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_6435  predicted protein  37.04 
 
 
111 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000000495197  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15510  predicted protein  29.66 
 
 
141 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  43.08 
 
 
668 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  42.19 
 
 
555 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71538  cytochrome b5  46.43 
 
 
124 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  42.11 
 
 
561 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11198  conserved hypothetical protein  39.73 
 
 
452 aa  59.3  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.788645 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  43.4 
 
 
593 aa  58.9  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  39.66 
 
 
587 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  38.55 
 
 
1016 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  39.66 
 
 
587 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 
552 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  49.02 
 
 
458 aa  56.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487731 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02590  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
488 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000954672  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  30.67 
 
 
659 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  36.84 
 
 
500 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  36.11 
 
 
891 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04424  mitochondrial cytochrome b2-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07020)  36.84 
 
 
494 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00446587  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  43.64 
 
 
635 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9095  predicted protein  36.62 
 
 
72 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143106  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  33.78 
 
 
510 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  36.62 
 
 
866 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02069  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04710)  35.44 
 
 
136 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12783  predicted protein  32.39 
 
 
517 aa  52.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00554714 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53263  cytochrome b2, mitochondrial precursor  33.93 
 
 
490 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.792612 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  41.18 
 
 
158 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31632  outer mitochondrial membrane isoform  35.62 
 
 
164 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0689191 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06394  acyl-CoA dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10880)  40 
 
 
512 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.263695  normal  0.350813 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  30.49 
 
 
873 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  35.29 
 
 
498 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08420  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 
135 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  36.36 
 
 
627 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07984  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 
503 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4191  cytochrome b5  48.78 
 
 
115 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80729  cytochrome b2, mitochondrial precursor  34.48 
 
 
581 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05828  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07720)  38.6 
 
 
84 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49358  predicted protein  44.9 
 
 
430 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000328404  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01620  L-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  32.76 
 
 
592 aa  45.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30770  predicted protein  38.33 
 
 
133 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50347  predicted protein  44.9 
 
 
430 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0373397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4296  cytochrome b5  33.72 
 
 
122 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506195  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1217  cytochrome b5  32.86 
 
 
121 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.832153  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01650  acyl-CoA dehydrogenase, long-chain specific precursor, putative  32.79 
 
 
522 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  41.82 
 
 
491 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  35.53 
 
 
490 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_9043  predicted protein  39.58 
 
 
74 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1363  cytochrome b5  42.22 
 
 
122 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386102  normal  0.151412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>