74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00680 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  100 
 
 
490 aa  1013    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  46.24 
 
 
369 aa  320  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  44.39 
 
 
376 aa  300  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  32.02 
 
 
206 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1688  fatty acid hydroxylase  33.03 
 
 
204 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  0.397039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  34.56 
 
 
210 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
235 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5323  fatty acid hydroxylase  32.64 
 
 
225 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  35.14 
 
 
222 aa  105  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  33.03 
 
 
220 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 
209 aa  91.3  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  30.09 
 
 
215 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  34.44 
 
 
209 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  33.55 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0294  fatty acid hydroxylase  33.73 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00278086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  33.77 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  33.96 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  33.96 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  34.01 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  32.14 
 
 
209 aa  67  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  34.42 
 
 
186 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  32.9 
 
 
209 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  33.56 
 
 
209 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9095  predicted protein  48.65 
 
 
72 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  33.77 
 
 
209 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71538  cytochrome b5  36.71 
 
 
124 aa  64.3  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  40.79 
 
 
158 aa  63.9  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  28.8 
 
 
210 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02069  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04710)  40 
 
 
136 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  37.5 
 
 
510 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  31.71 
 
 
891 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  45.28 
 
 
552 aa  57.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  56.82 
 
 
500 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_9043  predicted protein  36.84 
 
 
74 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11198  conserved hypothetical protein  38.67 
 
 
452 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.788645 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  53.19 
 
 
635 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04570  conserved hypothetical protein  54.55 
 
 
514 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  33.94 
 
 
866 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30770  predicted protein  41.46 
 
 
133 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06394  acyl-CoA dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10880)  51.06 
 
 
512 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.263695  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53263  cytochrome b2, mitochondrial precursor  43.14 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.792612 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  32.23 
 
 
555 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  37.18 
 
 
873 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1930  cytochrome b5  35.62 
 
 
122 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31632  outer mitochondrial membrane isoform  38.16 
 
 
164 aa  50.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0689191 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05146  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07200)  52 
 
 
475 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97854  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
458 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487731 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04424  mitochondrial cytochrome b2-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07020)  34.78 
 
 
494 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00446587  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1902  fatty acid hydroxylase  25.67 
 
 
183 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  42.62 
 
 
587 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  40 
 
 
561 aa  50.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  42.62 
 
 
587 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07984  conserved hypothetical protein  48.08 
 
 
503 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11632 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06731  Stearic acid desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJU5]  31.58 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01620  L-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  34.43 
 
 
592 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02590  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 
488 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000954672  normal  0.116226 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  27.4 
 
 
627 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  25.37 
 
 
276 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44466  NADPH cytochrome B5 oxidoreductase-like protein  37.97 
 
 
139 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.533393  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05828  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07720)  45.1 
 
 
84 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35395  predicted protein  29.41 
 
 
176 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0170226  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  26.72 
 
 
498 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01180  stearoyl-CoA 9-desaturase, putative  32 
 
 
594 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 
287 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  43.14 
 
 
600 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01090  cytoplasm protein, putative  35.53 
 
 
305 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15510  predicted protein  28.35 
 
 
141 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12783  predicted protein  34.48 
 
 
517 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00554714 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  44.68 
 
 
659 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4296  cytochrome b5  30.34 
 
 
122 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506195  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49003  predicted protein  36.21 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.939915  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08420  conserved hypothetical protein  34.25 
 
 
135 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  47.73 
 
 
593 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  26.11 
 
 
240 aa  43.5  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>