52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4296 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4296  cytochrome b5  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4191  cytochrome b5  80.7 
 
 		 115 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1217  cytochrome b5  70.83 
 
 		 121 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.832153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1930  cytochrome b5  69.49 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1363  cytochrome b5  54.55 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386102  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  44.26 
 
 		 668 aa  62  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02590  conserved hypothetical protein  44.23 
 
 		 488 aa  60.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000954672  normal  0.116226 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11198  conserved hypothetical protein  38.27 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.788645 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  47.27 
 
 		 587 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  47.27 
 
 		 587 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  44.59 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  40.54 
 
 		 510 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  42.25 
 
 		 561 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15510  predicted protein  44.26 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  37.04 
 
 		 498 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  35.71 
 
 		 500 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31632  outer mitochondrial membrane isoform  34.74 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0689191 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  34.72 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9095  predicted protein  35.53 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143106  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04424  mitochondrial cytochrome b2-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07020)  35.59 
 
 		 494 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00446587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30770  predicted protein  30.34 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 		 458 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487731 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12783  predicted protein  38.89 
 
 		 517 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00554714 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53263  cytochrome b2, mitochondrial precursor  38.78 
 
 		 490 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.792612 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  28.87 
 
 		 635 aa  50.4  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71538  cytochrome b5  27.85 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80729  cytochrome b2, mitochondrial precursor  32.22 
 
 		 581 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02069  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04710)  29.11 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16195  predicted protein  32.1 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  35.37 
 
 		 555 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_6435  predicted protein  32.1 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000000495197  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  34.92 
 
 		 552 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  35.53 
 
 		 891 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  33.33 
 
 		 866 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  35.38 
 
 		 1016 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44466  NADPH cytochrome B5 oxidoreductase-like protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.533393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  31.48 
 
 		 659 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  39.62 
 
 		 593 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01090  cytoplasm protein, putative  33.72 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_9043  predicted protein  35.21 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04570  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 		 514 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  30.34 
 
 		 490 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  31.43 
 
 		 376 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08420  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  27.18 
 
 		 873 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05146  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07200)  39.22 
 
 		 475 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97854  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06394  acyl-CoA dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10880)  39.29 
 
 		 512 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.263695  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01620  L-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  30.59 
 
 		 592 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  24.14 
 
 		 627 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06731  Stearic acid desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJU5]  30.34 
 
 		 455 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05828  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07720)  28.24 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  32.65 
 
 		 369 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>