61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03590 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  100 
 
 
535 aa  1113    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  41.35 
 
 
545 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  38.02 
 
 
573 aa  375  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  31.5 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  29.53 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  28.9 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  29.35 
 
 
347 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  28.7 
 
 
346 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  26.29 
 
 
477 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  28.37 
 
 
368 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  27.98 
 
 
342 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  24.93 
 
 
346 aa  97.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  25.76 
 
 
362 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  27.59 
 
 
357 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  26.45 
 
 
347 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  25.29 
 
 
366 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  24.79 
 
 
366 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  26.18 
 
 
365 aa  90.1  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  29.01 
 
 
357 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  27.37 
 
 
370 aa  87  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
321 aa  86.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  27.01 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  25.62 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  24.59 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  25.13 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  25.96 
 
 
358 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  25.96 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  23.43 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  24.2 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  26.64 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  23.08 
 
 
366 aa  67  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  23.91 
 
 
381 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 
364 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  22.81 
 
 
365 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  21.79 
 
 
434 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  25.17 
 
 
364 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  24.17 
 
 
364 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  24.27 
 
 
453 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  22.83 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  22.69 
 
 
361 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  20.23 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.99 
 
 
469 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  21.66 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  22.6 
 
 
360 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  24.11 
 
 
366 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  51.11 
 
 
627 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  21.19 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  22.81 
 
 
469 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  22.39 
 
 
386 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  25.11 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  38.03 
 
 
158 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  20.83 
 
 
418 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  23.93 
 
 
357 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  24.27 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  39.62 
 
 
659 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  28.36 
 
 
357 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  19.87 
 
 
413 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  26.96 
 
 
360 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  28.38 
 
 
891 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  29.55 
 
 
490 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  22.6 
 
 
394 aa  43.5  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>