114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2979 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  100 
 
 
366 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  36.64 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  31.4 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  31.21 
 
 
347 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  32.52 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  31.61 
 
 
366 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  31.23 
 
 
360 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  31.72 
 
 
357 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  31.44 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  29.97 
 
 
364 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  28.75 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  29.84 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  29.64 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  30 
 
 
321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  29.62 
 
 
362 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  29 
 
 
365 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  31.75 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  34.39 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  28.61 
 
 
341 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  28.04 
 
 
346 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  29.01 
 
 
342 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  31.37 
 
 
371 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  31.35 
 
 
357 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  28.73 
 
 
477 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  30.52 
 
 
366 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  27.98 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  26.4 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  26.8 
 
 
545 aa  93.6  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  30.42 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  26.67 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  28.49 
 
 
364 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  30.97 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  31.86 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  23.81 
 
 
573 aa  83.2  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  28.03 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  24.85 
 
 
498 aa  80.1  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  24.55 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  29.14 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  28.33 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  25.56 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  25.85 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  29.29 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  29.29 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  26.96 
 
 
517 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  26.57 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  24.61 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  24 
 
 
378 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  23.05 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.47 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.47 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.72 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  24.38 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  24.58 
 
 
359 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  24.61 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.09 
 
 
459 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  23.38 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  23.82 
 
 
535 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  23.77 
 
 
485 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  22.51 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  24.92 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  25.69 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  24.39 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  24.49 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  24.5 
 
 
427 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  26.22 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  26.99 
 
 
382 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  25 
 
 
453 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  27.61 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  23.93 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
469 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  22.43 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  22.43 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  23.05 
 
 
440 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  25.27 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  24.11 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  24.5 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  22.97 
 
 
448 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  24.83 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  24.42 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  25.91 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  27.04 
 
 
760 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
352 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  21.56 
 
 
357 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  24.49 
 
 
362 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  22.11 
 
 
418 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.14 
 
 
352 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  24.2 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  24.78 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  23.81 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  23.5 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>