69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4417 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  89.67 
 
 		 379 aa  671    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  100 
 
 		 379 aa  782    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  64.27 
 
 		 360 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  49.03 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  48.36 
 
 		 366 aa  343  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  52.94 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  30.11 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  29.55 
 
 		 364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  28.66 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  28.07 
 
 		 426 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  28.69 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  29.23 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25.83 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  26.96 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  26.23 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  29.06 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.07 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.92 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  27.82 
 
 		 491 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  25.09 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  23.4 
 
 		 366 aa  93.2  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  23.71 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  23.38 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  28.15 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  28.15 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.36 
 
 		 459 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  27.36 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  23.5 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  26.09 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  25.32 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4025  putative linoleoyl-CoA desaturase  54.9 
 
 		 55 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  24.49 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  25.42 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  26.27 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  26.55 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  24.45 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  24.8 
 
 		 485 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  25.07 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  22.61 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  20.31 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.81 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  24.73 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  22.61 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  25.42 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  24.29 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  21.15 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  21.02 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  30.53 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  23.79 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  21.43 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  24.38 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25.3 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  34.67 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  26.6 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  26.02 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  26.87 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  26.12 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  21.29 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  38.18 
 
 		 344 aa  43.1  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.32 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>