157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3762 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  100 
 
 		 356 aa  737    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  38.4 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  39.32 
 
 		 365 aa  265  8.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  34.99 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  35.9 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  38.36 
 
 		 371 aa  255  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  37.18 
 
 		 381 aa  252  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  34.57 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  37.71 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  34.57 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  37.22 
 
 		 363 aa  246  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  34.63 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  36.08 
 
 		 378 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  33.63 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  31.12 
 
 		 491 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  29.89 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  28.94 
 
 		 466 aa  149  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  28.94 
 
 		 465 aa  149  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  28.65 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.55 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  25.65 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  26.67 
 
 		 459 aa  119  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  30.24 
 
 		 453 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  28.77 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  24.65 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  28.86 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  28.86 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  26.43 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  29.75 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  29.75 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  27.76 
 
 		 517 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  27.96 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  26.71 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  25.82 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  27.31 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  27.15 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  25.76 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  26.92 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  27.3 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  27.07 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  25.67 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  25 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  24.93 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  26.55 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  28.52 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  25.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  28.08 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  25.75 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  24.36 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  25.94 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  25.89 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  26.4 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  24.2 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  25.53 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  22.7 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  25.16 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  25.88 
 
 		 760 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  24.55 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  24.55 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  23.68 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  29.44 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  22.92 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  27.37 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  22.08 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  21.43 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  23.82 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  21.26 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  27.78 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  29.28 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  21.78 
 
 		 452 aa  67  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  23.68 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  22.61 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  26.13 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  21.64 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  24.64 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  27.71 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.98 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  25.44 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  25.15 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  25.15 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  25.55 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  23.7 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  26.84 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  25 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  23.36 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  23.93 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.81 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  26.15 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.88 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  26.22 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>