56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4135 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  100 
 
 		 366 aa  758    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  95.87 
 
 		 363 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  66.2 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  50.69 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  49.59 
 
 		 379 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  48.36 
 
 		 379 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  26.56 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25.79 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  26.68 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  28.05 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  27.25 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  27.45 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  26.24 
 
 		 364 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  25.68 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  26.43 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25.76 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  26.98 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  22.99 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  23.98 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.72 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  26.97 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  25.4 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  24.93 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  26.04 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  26.54 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  26.54 
 
 		 466 aa  76.3  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  22.46 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  24.59 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  23.44 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  26.57 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  24.45 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  23.63 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  24.07 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  21.86 
 
 		 342 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  24.68 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4025  putative linoleoyl-CoA desaturase  43.14 
 
 		 55 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  23.24 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  41.27 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.33 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  20.07 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  25 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  20.07 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  26.04 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  20.72 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  25.22 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  20.07 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  20.72 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  20.72 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  20.72 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  20.72 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  29.37 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  20.72 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  32.43 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  21.91 
 
 		 485 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  22.61 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  24.07 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>