41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4416 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  95.87 
 
 		 366 aa  700    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  100 
 
 		 363 aa  751    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  65.18 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  50.83 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  49.44 
 
 		 379 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  49.03 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  27.05 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25.21 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  27.61 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  26.49 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  27.1 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  28 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  26.24 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  25.82 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  26.09 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  26.32 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.72 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  22.04 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  23.77 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  24.52 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  27.31 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  24.06 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  26.27 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  26.27 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  22.04 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  23.2 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  24.03 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  23.3 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4025  putative linoleoyl-CoA desaturase  44 
 
 		 55 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  23.59 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  30.16 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  25.5 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  21.56 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  41.27 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  33.78 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  22.57 
 
 		 485 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  25 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>