113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2285 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  100 
 
 
382 aa  790    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  73.09 
 
 
373 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  55.12 
 
 
370 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  52.92 
 
 
378 aa  391  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  56.71 
 
 
360 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  52.41 
 
 
369 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  52.41 
 
 
369 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  54.85 
 
 
362 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  50.56 
 
 
377 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  51.23 
 
 
380 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  49.86 
 
 
345 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  53.43 
 
 
760 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  48.54 
 
 
401 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  48 
 
 
380 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  48.48 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  47.73 
 
 
380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  46.41 
 
 
357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  47.61 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  45.92 
 
 
408 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  46.65 
 
 
400 aa  348  9e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  46.18 
 
 
356 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  45.2 
 
 
400 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  44.35 
 
 
394 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  47.34 
 
 
397 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  43.55 
 
 
400 aa  332  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  44.57 
 
 
413 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  44.08 
 
 
391 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  44.97 
 
 
452 aa  329  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  44.29 
 
 
413 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  44.29 
 
 
413 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  45.11 
 
 
427 aa  325  7e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  42.93 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  42.86 
 
 
409 aa  319  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  45.74 
 
 
387 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  42.62 
 
 
418 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  42.45 
 
 
440 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  42.78 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  43.5 
 
 
357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  43.94 
 
 
361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  41.4 
 
 
413 aa  313  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  42.9 
 
 
384 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  43.72 
 
 
370 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  43.66 
 
 
361 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  43.66 
 
 
361 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  43.79 
 
 
368 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  43.79 
 
 
368 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  42.7 
 
 
369 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  41.98 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  43.79 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  38.93 
 
 
464 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  38.93 
 
 
464 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  38.93 
 
 
464 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  43.04 
 
 
418 aa  305  9.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  37.96 
 
 
464 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  42.78 
 
 
448 aa  295  8e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  41.02 
 
 
382 aa  294  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  40.63 
 
 
469 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  39.26 
 
 
428 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  41.81 
 
 
360 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  27.24 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  25.59 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  28.04 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  27.3 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  25.15 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  23.2 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  28.21 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.86 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  27.4 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  25.74 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  26.27 
 
 
459 aa  69.3  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  26.69 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  24.66 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  30.83 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  26.09 
 
 
364 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  25.74 
 
 
465 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  25.74 
 
 
466 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  24.76 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  25 
 
 
358 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  22.72 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  22.39 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  24.73 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  25.37 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  23.93 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  24.38 
 
 
469 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  23.08 
 
 
363 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  26.01 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  22.87 
 
 
491 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  23.96 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  24.46 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  37.14 
 
 
366 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  23.94 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  34.29 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  23.89 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  31.51 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  31.51 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  21.65 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  24.37 
 
 
517 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>