109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3620 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  100 
 
 		 440 aa  911    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  68.69 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  61.48 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  61.43 
 
 		 413 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  61.43 
 
 		 413 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  61.2 
 
 		 413 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  60.93 
 
 		 418 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  63.04 
 
 		 415 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  60.86 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  60.67 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  58.13 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  55.07 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  55.61 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  54.89 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  53.73 
 
 		 382 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  55.56 
 
 		 368 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  55.56 
 
 		 368 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  55.28 
 
 		 368 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  56.25 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  54.96 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  54.96 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  54.96 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  54.47 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  51.19 
 
 		 409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  53.21 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  50 
 
 		 380 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  49.37 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  49.6 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  51.48 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  48.76 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  50.56 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  48.5 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  48.75 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  48.51 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  45.43 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  48.63 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  47.34 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  49.44 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  47.15 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  47.06 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  46.35 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  46.35 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  48.86 
 
 		 760 aa  358  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  45.11 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  46.07 
 
 		 356 aa  355  7.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  47.09 
 
 		 452 aa  352  8.999999999999999e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  39.64 
 
 		 464 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  41.98 
 
 		 464 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  41.98 
 
 		 464 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  41.98 
 
 		 464 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  46.28 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  43.85 
 
 		 357 aa  318  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  42.45 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  46.65 
 
 		 370 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  46.35 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  46.09 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  38.5 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  40.6 
 
 		 387 aa  280  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  38.68 
 
 		 370 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  26.26 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  23.2 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25.64 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  38.46 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.16 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  26.05 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  23.81 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  23.65 
 
 		 363 aa  67  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  26.67 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  25.18 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  24.57 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  25.89 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  32.58 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.35 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  26.54 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  25.77 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  36.67 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  36.49 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  32.11 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  32.58 
 
 		 364 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  29.09 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  24.57 
 
 		 360 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  35.44 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  37.1 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  37.66 
 
 		 341 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  24.54 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  30.34 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  38.81 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  22.44 
 
 		 378 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  34.62 
 
 		 365 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  30.34 
 
 		 362 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  31.46 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  22.22 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  25.18 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  33.77 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  29.41 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  32.61 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  30.85 
 
 		 321 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  25 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  31.46 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  39.68 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>