114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5610 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  97.79 
 
 
370 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  734    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  80.97 
 
 
360 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  57.42 
 
 
373 aa  408  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  55.96 
 
 
382 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  52.74 
 
 
345 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  51.59 
 
 
377 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  52.16 
 
 
378 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  51.3 
 
 
369 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  51.3 
 
 
369 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  51.99 
 
 
401 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  49.72 
 
 
380 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  48.72 
 
 
357 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  47.73 
 
 
394 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  45.71 
 
 
391 aa  345  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  50.59 
 
 
760 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  47.56 
 
 
380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  46.99 
 
 
380 aa  338  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  46.42 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  46.31 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  46.24 
 
 
400 aa  335  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  45.24 
 
 
408 aa  332  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  47.4 
 
 
360 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  46.29 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  47.11 
 
 
356 aa  326  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  45.24 
 
 
452 aa  323  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  45.14 
 
 
418 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  46.09 
 
 
448 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  44.35 
 
 
400 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  46.09 
 
 
440 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  45.14 
 
 
415 aa  316  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  44.57 
 
 
413 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  45.85 
 
 
452 aa  315  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  44.57 
 
 
413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  44.57 
 
 
413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  47.38 
 
 
387 aa  312  5.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  43.68 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  43.64 
 
 
413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  43.14 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  44.51 
 
 
361 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  44.23 
 
 
361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  44.23 
 
 
361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  46.2 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  38.58 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  43.02 
 
 
384 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  45.04 
 
 
469 aa  298  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  43.63 
 
 
357 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  37.82 
 
 
464 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  37.82 
 
 
464 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  37.82 
 
 
464 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  42.47 
 
 
428 aa  295  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  43.39 
 
 
369 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  43.33 
 
 
370 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
368 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
368 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  42 
 
 
401 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  41.43 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  41.67 
 
 
382 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  40.17 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  26.77 
 
 
365 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  26.37 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25.62 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  27.18 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  26.11 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  26.74 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  23.36 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.83 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  29.45 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  28.79 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  23.45 
 
 
485 aa  66.2  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  23.21 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  27.64 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  24.41 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  26.92 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  26.83 
 
 
426 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  26.07 
 
 
466 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  26.07 
 
 
465 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  26.13 
 
 
469 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  26.97 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  20.41 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  26.56 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  24.92 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  25.83 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  26.47 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  27.24 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  26.45 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  24.56 
 
 
491 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  26.23 
 
 
453 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  26.6 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.26 
 
 
459 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  25.28 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  27.08 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  25.8 
 
 
357 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  24.76 
 
 
455 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  22.94 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  23.71 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  25 
 
 
346 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  26.1 
 
 
517 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  22.11 
 
 
386 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>