142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0579 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  100 
 
 
378 aa  780    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  56.7 
 
 
381 aa  448  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  56.74 
 
 
363 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  43.13 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  40.62 
 
 
366 aa  296  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  39.66 
 
 
365 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  42.58 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  36.08 
 
 
356 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  37.5 
 
 
362 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  36.03 
 
 
364 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  34.52 
 
 
426 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  34.76 
 
 
364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  34.27 
 
 
364 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  32.29 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  31.97 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  31.01 
 
 
491 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  30.45 
 
 
365 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  28.69 
 
 
466 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  28.69 
 
 
465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  30.19 
 
 
354 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  24.86 
 
 
360 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  27.5 
 
 
469 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  22.83 
 
 
453 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  24.13 
 
 
459 aa  95.9  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  23.77 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  21.56 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  27.09 
 
 
455 aa  86.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  24.65 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  23.73 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  25.14 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  25.72 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  28 
 
 
517 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  23.64 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  26.76 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  21.64 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  25 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  26.84 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  20.99 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  21.75 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  26.37 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  21.84 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  25.43 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  25.43 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  24.3 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  22.97 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  22.76 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  23.47 
 
 
485 aa  63.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  24.83 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  23.31 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  22.16 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  22.63 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  21.8 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  24.73 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  21.41 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  24.53 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.94 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  24.25 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  23.22 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  26.57 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  41.49 
 
 
344 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  23.25 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  22.03 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  22.58 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  22.44 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  37.23 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  26.37 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  22.19 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  25.6 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  22.19 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  23.7 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  23.82 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  24.44 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  23.19 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  24.8 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  24.34 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  21.23 
 
 
370 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  22.22 
 
 
448 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  20.88 
 
 
369 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  20.56 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  25.19 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  23.22 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  24.01 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  23.48 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
452 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  23.05 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  22.81 
 
 
366 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  20.6 
 
 
452 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  24.76 
 
 
357 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  22.13 
 
 
418 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  23.05 
 
 
370 aa  53.1  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  35.14 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  21.68 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  21.68 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  25.37 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  21.18 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
357 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  23.12 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  24.14 
 
 
573 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  35.14 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  21.68 
 
 
361 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>