115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22459 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  100 
 
 
455 aa  952    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  54.48 
 
 
469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  29.8 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  28.33 
 
 
459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  30.36 
 
 
465 aa  126  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  30.36 
 
 
466 aa  126  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  24.65 
 
 
356 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  30.55 
 
 
364 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  25.59 
 
 
491 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  29.7 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  27.67 
 
 
363 aa  97.8  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  30.06 
 
 
364 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  28.06 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  24.84 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  25.67 
 
 
365 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  29.05 
 
 
426 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  27.09 
 
 
378 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  28.35 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  26.65 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  23.99 
 
 
360 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  26.33 
 
 
365 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  25.2 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  25.77 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  29.39 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  24.66 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  29.1 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  30.91 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  30.54 
 
 
362 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  28.26 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  27.95 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  26.4 
 
 
366 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  27.33 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  27.92 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  27.87 
 
 
342 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  27.42 
 
 
357 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  23.5 
 
 
485 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  24.41 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  27.41 
 
 
364 aa  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  26.12 
 
 
401 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  37.78 
 
 
370 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.33 
 
 
321 aa  59.3  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  22.2 
 
 
434 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  26.67 
 
 
346 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  25.93 
 
 
418 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  24.16 
 
 
354 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  48.33 
 
 
760 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  24.6 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
452 aa  55.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  40.26 
 
 
345 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  25.58 
 
 
365 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
357 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  39.44 
 
 
469 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  22.61 
 
 
368 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  22.61 
 
 
368 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  22.76 
 
 
368 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  25.41 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  40.58 
 
 
394 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  25 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  39.06 
 
 
400 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  24.68 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  37.66 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  37.66 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  32.61 
 
 
440 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  36.11 
 
 
391 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  31.82 
 
 
343 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  24.08 
 
 
415 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  31.82 
 
 
343 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  32.18 
 
 
387 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
370 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  24.23 
 
 
390 aa  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  40.98 
 
 
377 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  26.02 
 
 
341 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  41.67 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  32.89 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  35.29 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  33.93 
 
 
360 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  21.74 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  29.31 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  34.62 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  21.65 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  34.57 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  32.61 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  38.46 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  25.8 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  39.06 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  25.15 
 
 
372 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  37.68 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  32.05 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  34.43 
 
 
464 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  38.46 
 
 
361 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  34.43 
 
 
464 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  38.46 
 
 
361 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  34.43 
 
 
464 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  47.92 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  38.6 
 
 
380 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  44.68 
 
 
417 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  32.61 
 
 
413 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  32.61 
 
 
413 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  24.27 
 
 
535 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  32.22 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>