95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  100 
 
 
452 aa  932    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  64.4 
 
 
408 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  65.72 
 
 
380 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  64.04 
 
 
380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  60.89 
 
 
397 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  63.69 
 
 
409 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  61.33 
 
 
384 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  61.19 
 
 
394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  59.21 
 
 
391 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  60.06 
 
 
452 aa  430  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  56.32 
 
 
400 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  55.84 
 
 
401 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  52.41 
 
 
413 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  53.03 
 
 
360 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  50.43 
 
 
400 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  50.56 
 
 
418 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  55.01 
 
 
361 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  48.74 
 
 
378 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  55.01 
 
 
361 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  50.42 
 
 
356 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  52.57 
 
 
368 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  52.57 
 
 
368 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  53.87 
 
 
357 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  50.28 
 
 
415 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  50.42 
 
 
427 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  54.73 
 
 
361 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  50.28 
 
 
413 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  50.28 
 
 
413 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  52.29 
 
 
368 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  50.28 
 
 
413 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  51.27 
 
 
469 aa  362  6e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  53.1 
 
 
760 aa  362  9e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  51.72 
 
 
369 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  47.73 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  47.73 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  51.13 
 
 
360 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  49.28 
 
 
345 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  48.19 
 
 
418 aa  352  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  47.09 
 
 
440 aa  352  8.999999999999999e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  48.7 
 
 
400 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  48.41 
 
 
377 aa  347  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  45.74 
 
 
380 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  49.86 
 
 
382 aa  346  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  50 
 
 
401 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  42.68 
 
 
464 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  46.11 
 
 
390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
464 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
464 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
464 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  43.87 
 
 
373 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  45.63 
 
 
428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
357 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  42.93 
 
 
382 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  45.85 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  42.02 
 
 
448 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  45.85 
 
 
362 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  47.14 
 
 
360 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  42.37 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  42.15 
 
 
387 aa  279  9e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  26.39 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25.33 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  24.8 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  24.36 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  24.26 
 
 
365 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  27.11 
 
 
491 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  25.2 
 
 
368 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  30.16 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  39.19 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  24.36 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  22 
 
 
378 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  32 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  32.94 
 
 
362 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  24.03 
 
 
360 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  26.29 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  35.37 
 
 
443 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  32.14 
 
 
366 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  38.33 
 
 
346 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  25.91 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  22.73 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  32.05 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  31.82 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  22.32 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  28 
 
 
357 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  38.33 
 
 
341 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  22.95 
 
 
459 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  32.89 
 
 
362 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  36.07 
 
 
370 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  21.78 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  29.41 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  35.38 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  25.11 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  21.88 
 
 
364 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  34.48 
 
 
347 aa  43.5  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  32.39 
 
 
365 aa  43.5  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>