146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1533 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  100 
 
 		 341 aa  698    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  95.48 
 
 		 346 aa  624  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  44.41 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  40.06 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  43.67 
 
 		 346 aa  255  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  41.99 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  42.43 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  40.12 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  38.14 
 
 		 365 aa  245  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  40.83 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  39.04 
 
 		 357 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  38.11 
 
 		 368 aa  238  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  38.07 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  39.7 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  38.48 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  38.89 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  38.41 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  41.27 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  38.58 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  38.46 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  30.68 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  28.9 
 
 		 535 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  27.35 
 
 		 545 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  28.96 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  27.27 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  27.91 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  25.36 
 
 		 573 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.96 
 
 		 371 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  25.53 
 
 		 498 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  23.87 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  23.93 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  28.03 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  28.48 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  28.48 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  25.84 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  25.68 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  28.63 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  26.23 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  25.45 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  29.37 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  29.37 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  26.47 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  45.59 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  24.44 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.97 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  27.19 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  26.51 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  26.83 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  27.73 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  26.51 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  27.33 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  36.84 
 
 		 452 aa  62.8  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  26.45 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  25.98 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 760 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  32.35 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.38 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  24.27 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  27.95 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  25.73 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  34.57 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  28.95 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  26.16 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  26.89 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  26.07 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  28.68 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  27.92 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  24 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  24 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  24 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  24.79 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  29.9 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  27.12 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  24.58 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  24.34 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  24.34 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  24.34 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  36.23 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  28.85 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  24.34 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  26.13 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.97 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  37.66 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  30.43 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  24.34 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  24.34 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  24.34 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.97 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.97 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  24.58 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  26.64 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  41.18 
 
 		 443 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>