140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0898 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  100 
 
 
366 aa  750    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  45.53 
 
 
360 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  43.75 
 
 
365 aa  325  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  43.42 
 
 
366 aa  322  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  43.42 
 
 
381 aa  302  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  43.13 
 
 
378 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  41.78 
 
 
363 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  37.91 
 
 
362 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  37.33 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  34.63 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  37.09 
 
 
364 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  37.39 
 
 
364 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  35.85 
 
 
371 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  33.8 
 
 
426 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  28.45 
 
 
365 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  31.28 
 
 
491 aa  176  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  28.81 
 
 
386 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  29.85 
 
 
465 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  29.85 
 
 
466 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  30.55 
 
 
354 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  26.92 
 
 
459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  25.21 
 
 
363 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  25.28 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  31.05 
 
 
469 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  25.81 
 
 
361 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  25.07 
 
 
360 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  25.63 
 
 
379 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  26.67 
 
 
379 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  25.22 
 
 
453 aa  92.8  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  27.35 
 
 
377 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  27.49 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  26.11 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  26.11 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  31.12 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  26.65 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  26.78 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  30 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  25.07 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  28.95 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  27.8 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  29.15 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  26.76 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  26.98 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  25.15 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  25.07 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  26.67 
 
 
401 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  26.38 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  25.74 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  26.47 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  27.35 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  26.27 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  26.69 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  26.18 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  28.42 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  28.35 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  24.86 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  26.83 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  24.5 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  28.82 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  23.36 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  27.54 
 
 
760 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  26.36 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  24.12 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  26.99 
 
 
391 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  23.53 
 
 
485 aa  66.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  24.52 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  28.09 
 
 
452 aa  66.2  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  24.78 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  25.38 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  27.08 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  26.4 
 
 
498 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  24.78 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  26.09 
 
 
357 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  26.41 
 
 
394 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  27.07 
 
 
370 aa  63.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  25.94 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  25.45 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  23.88 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  23.88 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  23.88 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
401 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  24.43 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  22.38 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  22.09 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  22.51 
 
 
400 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  21.15 
 
 
413 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  21.15 
 
 
413 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  21.15 
 
 
413 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  22.9 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  26.57 
 
 
362 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  26.06 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  23.45 
 
 
464 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  24.72 
 
 
434 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  25.47 
 
 
362 aa  57  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  25.09 
 
 
573 aa  56.2  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  23.58 
 
 
464 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>