81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2862 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2862  fatty acid desaturase  100 
 
 		 361 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4416  fatty acid desaturase  65.18 
 
 		 363 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4135  fatty acid desaturase  66.2 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2863  fatty acid desaturase  54.62 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4417  fatty acid desaturase  52.94 
 
 		 379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4136  fatty acid desaturase  51.54 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  30.9 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  31.32 
 
 		 364 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  32.07 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  26.39 
 
 		 366 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  30.11 
 
 		 364 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  30.03 
 
 		 362 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  28.25 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  27.43 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  28.49 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25.2 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  25.48 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  25.77 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  22.52 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  23.48 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.82 
 
 		 360 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  25.23 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  26.89 
 
 		 491 aa  86.3  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.29 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  25.97 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  25.97 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  28.4 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  27.6 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  28 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  26.32 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  22.56 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  24.5 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.92 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.93 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  23.35 
 
 		 382 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  25.42 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  21.8 
 
 		 361 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  23.81 
 
 		 498 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  27.11 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  25.83 
 
 		 760 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4025  putative linoleoyl-CoA desaturase  56.6 
 
 		 55 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  24.14 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  25.53 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  25 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  23.19 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  23.63 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  27.03 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  26.17 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  25.44 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  23.47 
 
 		 469 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  21.78 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  22.57 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  22.3 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.05 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  23.43 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  22.81 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  22.47 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  22.03 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  23.35 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  24.05 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  24.55 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.47 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  23.35 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  21.68 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  23.66 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  21.05 
 
 		 418 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.09 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  29.46 
 
 		 359 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>