110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1576 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  100 
 
 		 400 aa  836    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  73.44 
 
 		 390 aa  587  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  64.06 
 
 		 378 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  62.64 
 
 		 377 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  58.15 
 
 		 369 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  58.15 
 
 		 369 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  56.58 
 
 		 380 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  60.76 
 
 		 345 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  56.16 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  56.32 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  53.46 
 
 		 380 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  53.47 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  53.19 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  54.81 
 
 		 760 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  50.58 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  51.27 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  51.16 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  51.8 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  50.97 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  50 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  50 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  50.69 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  50.57 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  50.99 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  49.57 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  49.72 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  48.63 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  49.45 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  49.45 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  49.45 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  49.17 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  49.28 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  50.69 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  49.58 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  48.31 
 
 		 401 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  48.7 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  43.36 
 
 		 464 aa  348  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  46.65 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  47.27 
 
 		 387 aa  347  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  47.89 
 
 		 382 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  48.1 
 
 		 418 aa  345  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  47.25 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  47.25 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  41.6 
 
 		 464 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  41.6 
 
 		 464 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  41.6 
 
 		 464 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  46.96 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  48.01 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  48.12 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  47.73 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  47.73 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  46.24 
 
 		 370 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  47.54 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  48.99 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  44.51 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  46.24 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  43.29 
 
 		 428 aa  311  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  41.94 
 
 		 370 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  44.19 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  25.21 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  23.2 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  24.75 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  26.83 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  28.08 
 
 		 356 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  26.3 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  28.03 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  27.27 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  25.48 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  27.97 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  24.08 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  26.2 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  26.35 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  23.81 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  23.16 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  25.52 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  25.93 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  25.27 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  23.01 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  25.95 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  26.03 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  24.32 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  31.54 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  24.6 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  22.9 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  24.23 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  26.87 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  29.79 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  34.07 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  34.62 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  25.19 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  24 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  25.15 
 
 		 361 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  32.05 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25 
 
 		 455 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  24.43 
 
 		 321 aa  53.1  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  30.68 
 
 		 346 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  24.22 
 
 		 465 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  24.38 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  24.22 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0145567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>