More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2658 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  100 
 
 
760 aa  1531    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  72.41 
 
 
401 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  67.72 
 
 
360 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  59.4 
 
 
380 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  68.75 
 
 
360 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  58.08 
 
 
380 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  56.64 
 
 
378 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  57.02 
 
 
408 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  58.55 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  55.74 
 
 
394 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  59.59 
 
 
356 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  56.1 
 
 
377 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  54.26 
 
 
391 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  55.49 
 
 
409 aa  432  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  51.86 
 
 
400 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  55.23 
 
 
345 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  55.08 
 
 
452 aa  425  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  54.36 
 
 
369 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  54.36 
 
 
369 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  52.25 
 
 
380 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  54.12 
 
 
397 aa  416  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  53.28 
 
 
390 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  50.83 
 
 
413 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  49.6 
 
 
418 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  52.74 
 
 
384 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  45.64 
 
 
464 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  54.57 
 
 
373 aa  392  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  45.64 
 
 
464 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  45.64 
 
 
464 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  45.39 
 
 
464 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  47.78 
 
 
440 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  49.6 
 
 
413 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  51.74 
 
 
382 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  51.47 
 
 
401 aa  389  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  53.16 
 
 
452 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  49.6 
 
 
413 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  50.55 
 
 
469 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  49.6 
 
 
413 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  49.72 
 
 
400 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  49.87 
 
 
415 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  52.02 
 
 
357 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  52.33 
 
 
382 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  60.61 
 
 
357 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  48.22 
 
 
427 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  47.4 
 
 
357 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  51.14 
 
 
368 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  51.16 
 
 
368 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  51.16 
 
 
368 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  50.14 
 
 
369 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  50.84 
 
 
370 aa  360  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  56.04 
 
 
372 aa  360  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  46.58 
 
 
418 aa  359  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  57.71 
 
 
363 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  49.57 
 
 
361 aa  356  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  49.57 
 
 
361 aa  356  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  49.29 
 
 
361 aa  354  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  51.01 
 
 
362 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  50 
 
 
370 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  51.29 
 
 
360 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  52.99 
 
 
376 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  52.99 
 
 
376 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  53.41 
 
 
368 aa  337  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  43.83 
 
 
428 aa  336  9e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  53.43 
 
 
379 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  52.14 
 
 
376 aa  333  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  47.09 
 
 
387 aa  332  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  46.18 
 
 
360 aa  331  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  52.85 
 
 
366 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  45.63 
 
 
448 aa  326  9e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  50.71 
 
 
380 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.03 
 
 
371 aa  323  6e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  49.86 
 
 
385 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  51.15 
 
 
367 aa  320  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  48.7 
 
 
381 aa  319  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.58 
 
 
370 aa  313  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  49.33 
 
 
381 aa  307  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  49.48 
 
 
374 aa  304  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  46.33 
 
 
360 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  46.33 
 
 
360 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  49.32 
 
 
384 aa  300  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  43.94 
 
 
366 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  52.82 
 
 
363 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  50.14 
 
 
350 aa  290  8e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  44.72 
 
 
375 aa  272  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  46.4 
 
 
247 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.66 
 
 
376 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.75 
 
 
346 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.89 
 
 
382 aa  178  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.34 
 
 
368 aa  177  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  38.35 
 
 
355 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.35 
 
 
355 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.78 
 
 
354 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.07 
 
 
355 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.31 
 
 
350 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  34.47 
 
 
358 aa  148  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  35.57 
 
 
358 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  33.74 
 
 
353 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  31.51 
 
 
605 aa  134  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  33.03 
 
 
355 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  30.41 
 
 
355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>