109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4132 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  100 
 
 
413 aa  865    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  62.38 
 
 
400 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  60.86 
 
 
440 aa  528  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  61.56 
 
 
427 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  62.44 
 
 
469 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  63.97 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  60.64 
 
 
418 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  58.29 
 
 
418 aa  494  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  56.97 
 
 
413 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  56.97 
 
 
413 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  56.97 
 
 
413 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  56.08 
 
 
401 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  59.8 
 
 
415 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  60.67 
 
 
368 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  60.67 
 
 
368 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  58.82 
 
 
368 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  54.67 
 
 
428 aa  471  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  56.8 
 
 
382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  56.63 
 
 
357 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  58.15 
 
 
361 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  58.15 
 
 
361 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  58.15 
 
 
361 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  55.96 
 
 
360 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  55.9 
 
 
369 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  53.66 
 
 
380 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  55.49 
 
 
380 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  53.23 
 
 
409 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  54.93 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  54.18 
 
 
378 aa  415  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  54.49 
 
 
360 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  52.6 
 
 
401 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  50.5 
 
 
408 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  54.36 
 
 
377 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  53.58 
 
 
391 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  53.2 
 
 
345 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  54 
 
 
452 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  51.27 
 
 
369 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  51.27 
 
 
369 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  52.41 
 
 
452 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  50.68 
 
 
384 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  51.27 
 
 
400 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  50 
 
 
380 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  51.93 
 
 
760 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  52.37 
 
 
397 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  49.71 
 
 
356 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  48.75 
 
 
390 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  48.84 
 
 
357 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  43 
 
 
464 aa  358  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  42.96 
 
 
464 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  42.96 
 
 
464 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  42.96 
 
 
464 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  44.57 
 
 
373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  41.4 
 
 
382 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  39.08 
 
 
448 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  43.93 
 
 
370 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  38.67 
 
 
370 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  45.24 
 
 
360 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  43.64 
 
 
362 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  40.4 
 
 
387 aa  280  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  23.1 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  37.6 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  26.17 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  27.02 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  24.27 
 
 
365 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  22.26 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  24.32 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  26.2 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  42.03 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  24.38 
 
 
358 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  27.71 
 
 
357 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  25.11 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  24.69 
 
 
386 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  25.16 
 
 
366 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  33.71 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  24.26 
 
 
465 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  33.67 
 
 
375 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  25.34 
 
 
459 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  24.26 
 
 
466 aa  60.1  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  36.59 
 
 
346 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  24.84 
 
 
364 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  22.45 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.76 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  29.27 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  24.89 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  24.33 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  35.9 
 
 
366 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  23.64 
 
 
469 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  23.16 
 
 
364 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.88 
 
 
360 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  22.56 
 
 
361 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  34.18 
 
 
347 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  39.13 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  22.85 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  23.91 
 
 
365 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  24.32 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  23.67 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  23.37 
 
 
453 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  40.32 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  22.78 
 
 
491 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  34.62 
 
 
342 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>